近两年，滇中城市经济圈化学需氧量、氨氮排放量，分别占全省的40%和20%，滇池、杞麓湖、星云湖、异龙湖水环境容量已严重超载，三大水系国控和省控断面达标率仅为55.9%，河流水系水质总体属于中度污染。

预计到2020年，滇中城市经济圈的化学需氧量、氨氮、二氧化硫和氮氧化物的排放量，将比2013年增长1倍以上。目前，全省7个酸控区，有6个位于滇中城市经济圈。另外，滇中城市经济圈仍有部分建制镇，尚无污水处理设施，建有污水处理厂的城镇，普遍存在排水管网配套不完善的问题。

整个经济圈的污染介质，已从以大气和水为主，逐渐向大气、水和土壤3种介质共存转变；污染物来源从以工业和生活污染为主，不断向工业、生活和农村农业面源污染转变；污染特征从单一型、点源污染，向复合型、跨界污染转变，治理难度加大。

滇中城市经济圈环保一体化专项规划的目标是，到2016年，区域环境保护一体化体制机制初步建立，跨界水污染综合整治取得突破性进展，六湖中现有水质优良湖泊继续保持稳定，污染严重湖泊总体上水质有所改善，三大水系监测断面水质达标率超过70%，集中式饮用水源水质达标率达100%，城镇生活垃圾无害化处理率超过90%，城市污水处理率超过93%，工业废水排放达标率达到100%，重金属污染得到控制。多种大气污染物联合减排初见成效，空气环境质量有所改善，区域生态安全格局基本形成，环境安全得到基本保障。

到2020年，整个经济圈建成高效的区域环境保护一体化体制机制政策体系，三大水系监测断面水质达标率超过85%，集中式饮用水源水质达标率稳定保持100%，城镇生活垃圾无害化处理率和城市污水处理率超过95%，环境污染得到有效控制，环境质量进一步改善，生态系统步入良性循环，全面建成共保共育、生态安全、环境优良的生态环保体系，生态环境质量全国领先，生态文明建设迈上新台阶。