相比20多年前那场横贯昆明主城区的马拉松赛，前五届昆马的赛道一直在呈贡新区，这也让前来参赛的跑友们颇有怨言。这是因为呈贡新区赛道相对距离市区较远，或多或少会影响比赛的参与程度；此外，赛道不能经过昆明主城，无法充分展现昆明市的自然、历史、人文风貌和景观。

事实上，2016年昆马筹备工作刚一启动，对比赛线路的调整就列入了议事日程。12月初，昆马组委会确定了“让昆马从我家门口跑过”的主题，并通过媒体发起了“想跑哪里，你说了算”的建议征集活动。最终确定2016年昆马路线以金马碧鸡坊为起点，途经东西寺塔、环城南路、滇池路、红塔东路、环湖东路、湖滨路、海埂公园、海埂大坝，以云南海埂会堂为终点。

赛事组委会负责人介绍，2016年昆马比赛线路再次回到主城区，途经金马碧鸡坊、东西寺塔、陆军讲武堂等地标性建筑，一是可以展现昆明作为国家首批“历史文化名城”深厚的底蕴，二是这是国际化马拉松比赛的大势所趋：北京马拉松经过天安门，上海马拉松经过外滩，柏林、波士顿、巴黎等世界著名马拉松赛等均在主城区举行，“2016昆马比赛线路集中展现了昆明历史文化名城风貌、昆明经济社会发展水平、昆明生态文明建设成果，是昆明城市景观、人文景观和自然风光的有机结合，是昆明人幸福生活的集中缩影。”

云南著名马拉松跑友“云南牛人”马亮武跑过全国绝大部分的马拉松赛事，也参加过很多著名的国际赛事。他表示，在世界很多地方的马拉松，赛道路线都会经过城市的地标，这也是展现城市文化内涵的需要，“不是说在城市里跑就叫城市马拉松，一个马拉松应该能充分展现这座城市的特质。” 

云南著名越野跑选手“跑者八零”王晓林说，以目前国内最有名的厦门城市马拉松为例，赛道路线途经鼓浪屿、演武大桥、厦大等城市地标，“跑过一圈，对厦门的城市景点一目了然，感受到的是浓浓的城市文化。”再以北京马拉松为例，路线途经天安门、长安街、鸟巢等北京地标，“比赛的时候这些地方都是交通管制的，这时候路上只有奔跑的人，那种开阔的感觉让人能体会到不一样的北京，很多跑友就是为了在比赛当天在天安门拍张照片，年年都要去参加北马。”

王晓林表示，前几年的昆马路线都是在呈贡，距离昆明主城区远了些，比赛过程中，在路边加油鼓劲的观众肯定不如在主城那么多。“跑马拉松的过程是一种交流，体现的是跑者之间、跑者和观众之间的交流互动，所以观众也必不可少。明年昆马路线进城后，前来观战的观众肯定会成倍增加，大家跑起来也会更有气氛，更有动力。”