昆明地区历史上曾是多种地方病流行的地区，其中又以碘缺乏病流行范围最广，危害最为严重，时至今日，碘缺乏病病因仍不能消除，自然环境中碘含量不足以满足人体正常碘代谢，全市14个县(市)区都曾不同程度地有碘缺乏病流行，受威胁人口600余万。

自上世纪90年年代起，昆明市按照国家和省的规划部署，制定并实施了昆明市消除碘缺乏病防治规划，落实各项综合防治措施。在2000年如期实现了消除碘缺乏病阶段性目标后，2005年、2007年在全市范围进行抽样检测，各项指标合格率逐年升高，持续巩固全市消除碘缺乏病阶段性目标成果。2009年市级评估调查结果显示，8—10岁儿童甲状腺肿大率2.16%、尿碘水平272.8 微克/升、居民合格碘盐的食用率95.13%，全市14县区全部达到了实现消除碘缺乏病目标的标准要求。

2010年接受国家专家组考评，昆明市达到实现消除碘缺乏病目标。目前，全市所有县(市)区保持消除碘缺乏病状态，人群碘营养水平总体保持适宜状态，全市处于持续巩固的状态。